氮氣水封罐首次投運時，先用氮氣將罐內部的空氣置換完畢，再關閉氮氣管線上的閥門和排污閥，而打開底部側向的觀察排水閥，打開注水閥。新鮮水在上腔灌注到與上下腔連通管上端齊平時向下腔流動，當水面與液封隔板齊平后，多余的新鮮水將從觀察排水閥流出，此時充灌結束，關閉注水閥，待觀察排水閥無水流出后將其關閉。